ในปัจจุบันยังไม่ทราบสาเหตุที่แท้จริงของโรค เอส แอล อี แต่มีหลักฐาน
ที่บ่งบอกว่าปัจจัยต่าง ๆ เหล่านี้มีส่วนร่วมในการทำให้เกิดโรค เอส แอล อี นั่นคือ
กรรมพันธุ์
ฮอร์โมนเพศหญิง
ภาวะติดเชื้อโรคบางชนิด เช่น เชื้อไวรัสบางอย่าง
นอกจากนี้ยังมีปัจจัยเสริมที่ทำให้ผู้ป่วยที่เป็นโรค เอส แอล อี หรือมีโอกาส
จะเป็นมีอาการกำเริบขึ้น เช่น
แสงแดด หรือแสงอุลตร้าไวโอเลต
การตั้งครรภ์
ยาหรือสารเคมีบางชนิด
การออกกำลังกายหรือทำงานหนัก
ภาวะเครียดทางจิตใจ